Die Abteilung ist in drei Niederlassungen aufgeteilt:
- Niederlassung Litomerice – Krajska: Die Niederlassung verwaltet Archivalien aus der Provenienz von Behörden und Organen der Staatsverwaltung und der Selbstverwaltung, sowie Archivalien der Körperschaften und kirchlicher Institutionen auf Gebiets- und Regionalebene. Die hier aufbewahrten Archivalien der politischen Verwaltung umfassen nur die Zeitperiode 1938-1945.
- Niederlassung Litomerice – Kamycka: Die Niederlassung verwaltet adelige Familienarchive sowie land- und forstwirtschaftliche Archive – Bestände adeliger Großgrundbesitze, deren Zentraldirektionen, Archive aufgelassener Staatsgüter, landwirtschaftlicher Verwaltungsbehörden und Forschungsinstitute. Des Weiteren werden hier Archivbestände der politischen Verwaltung auf Gebiets- und Regionalebene (außer der Zeitperiode 1938-1945) aufbewahrt.
- Niederlassung Brüx: Die Niederlassung verwaltet Archivalien aus der Provenienz von Industrieunternehmen, die direkt von den Bestandsbildnern oder aus aufgelassenen Werksarchiven übernommen wurden. In der Niederlassung sind auch die Bestände der Bergbauämter deponiert.